В пятницу, 11 октября, несколько десятков студентов ФОПФ пришли в ректорат, чтобы передать Николаю Кудрявцева свои требования. Его там не оказалось, и студенты приняли решение не покидать ректорат до тех пор, пока ректор им не ответит. Студенты
находились там около 5 часов: с утра до 15:00. Некоторые уходили на пары, но потом возвращались. По приблизительным подсчетам, на протяжении всего времени там постоянно находилось 70-80 человек.
В 15 часов к протестующим пришел Валерий Киселев. Он заявил, что принял решение уйти из Физтеха, и пригласил всех желающих пойти с ним в клуб общежития, чтобы последний раз пообщаться в этой обстановке. Все ушли с ним. На этом в пятницу протест завершился.
В тот момент многие подумали, что на этом все полностью закончится. Но уже в субботу стало понятно, что студенты не успокоились: во-первых, требование разделить Физтех-школу оставалось актуальным, а во-вторых, у многих возникло подозрение, что решение Киселева об уходе было принято под давлением ректора и что оно может быть изменено.
В понедельник, 14 октября, протесты возобновились. С 9 утра студенты снова начали собираться в ректорате. В какой-то момент сотрудники охраны перестали пускать студентов в ректорат, аргументируя это нарушением правил пожарной безопасности: якобы толпа людей мешала проходу. Студенты, которые не смогли войти внутрь, оставались рядом с ректоратом. Всего на этот раз студентов было около сотни.
Через некоторое время к студентам вышел проректор по безопасности Василий Субботин. Он потребовал покинуть ректорат и пригрозил привлечением к ответственности за организацию несанкционированного массового мероприятия. Его требование студенты проигнорировали. Однако вскоре в ректорате появился Киселев, который попросил студентов послушать Субботина, пояснив, что в противном случае это может иметь последствия и для него лично.
Студентам было предложено пройти в одну из пустых аудиторий, чтобы там поговорить с проректором Артемом Вороновым, который был назначен врио директора Физтех-школы. Правда, вскоре стало понятно, что эта беседа ни к чему не приведет, так как большая часть вопросов от студентов лежала вне компетенции Воронова — ответ на них мог дать только ректор.